Siempre ha sido un poco irónico que Google Reader siendo de propiedad un buscador, no tengo opción a buscar algo dentro de los feeds. Ahora con este script para la extensión Greasemonkey de Firefox, ya puedes hacerlo:
Utiliza Google Co-op para las búsquedas, así que solo funciona al ver un solo feed… que ya es bastante.
Javier Aroche 
No te he entendido, quiere decir que sólo funciona el script cuando en el google reader no hay mas que una sola feed? o es que puede buscar en una sola feed a la vez?
aja, solo podes buscar en un feed a la vez. Si estas en All Items, stared o shared no funciona.