Yo siempre he preferido usar sftp desde la linea de comandos que usar la basura de gFTP cuando estoy en ubuntu. El problema es que no hay opción a limitar la velocidad de carga o bajada, utiliza todo lo que el server o la linea de lo cual no me gusta ya que me deja con navegación lenta.
Eso era hasta que en los foros de ubuntu mencionaban Trickle una herramienta adicional para limitar el ancho de banda de cualquier programa que se ejecute con él. Asi por ejemplo ejecutas:
$ trickle -d 60 -u 20 sftp usuario@servidor.tld
Esto limitará las transferencias de sfpt a 60KB/s (promedio) de bajada y 20 KB/s de subida. El limite es promedio ya que tiende a variar un poco, pero es suficiente para cuando debo descargar backups de 1.6GBs.
Para instalarlo en ubuntu basta con ejecutar:
$ aptitude install trickle
Y listo, los programas que no tienen configuración para limitar la transferencia ahora lo tendrán 🙂
Javier Aroche 
Interesante herramienta… no la conocía, gracias por el dato.
Interesante porque te deja con toda libertad de seguir trabajando 😀
y para gentoo? =P